Olá Hercelino, tudo bom?

Olha só, de Lima para Cuzco além de longe é um perrengue hahaha, até pq são quase 24 de bus e a estrada não é das melhores! mas dá pra fazer sim!

Olha, só indico duas cia de bus no Perú! pq? já viajei com inumeras lá, e essas apesar de serem um poucos mais caras, são mais seguras e confortáveis. 

http://www.oltursa.pe/

http://www.cruzdelsur.com.pe/

Outra coisa que vale a pensa conferir... o Real e o Soles estão praticamente valendo a mesma coisa, então acho que vale consutar o preço dos voos, as vezes fica bem mais barato comprando lá.

Uma dica: Se tiver um tempo legal pra viajar por lá, e querer fazer isso de onibus mesmo, você pode fazer paradas em vários lugares até Cusco e conhecer realmente o Perú.

Indico passar por Huacachina (o bus para em Ica) Pisco Paracas Nazca  e se tiver mais tempo ainda dá pra fazer outros lugares como Huancayo Satipo Puerto Ocopa , esse ultimos citados, há necessidade de voltar a Lima para depois ir a Cusco, apesar de ficar na rota, não há linhas de bus interligando. De puerto ocopa sai um barco que vaí até Cusco (na verdade são dois barcos e um bus) mas pode demorar até 48 horas, vai depender do tipo de viagem que busca!

espero ter ajudado

abraços