Olá João!

Em Madrid indico o Los Amigos Hostel 
, que fica na Calle Arenal, ao lado do metrô Ópera e a poucos passos da Porta do Sol. Dali você vai andando pra todos os lugares, achei o ambiente muito agradável. Parecia que eu tava na casa de amigos mesmo. Custo/benefício excelente.

Londres: qualquer um da rede YHA. 

Atenas: Pella Inn Hostel Localização perfeita e conheci uma galera bem legal.

Nos demais lugares fiquei em casa de amigos e hotéis, mas em Roma te aconselharia a se hospedar perto da Estação Termini, em Praga fique na área da Cidade Velha, e em Paris algum com metrô próximo.

Boa viagem!!